软著申请后，要对软件著作权进行转让。首先进行软件著作权转让登记，可以通过以受让方为申请人填写“计算机软件著作权登记申请表”，该方式可以参考原始登记，但是登记前须办理著作权登记概况查询申请，软著申请后的查询结果是办理转让登记申请的文件之一。查询阶段：以转让方为申请人，提供查询申请表（中国版权保护中心网站在线填写打印）、原登记证书复印件加盖公章，转让方身份证明复印件盖章以及联系人的身份证正反面复印件签字；查询结果的获取周期不好预估，通常至少一个月。

转让登记阶段：获得软著申请的查询结果之后。中国版权保护中心网站在线填写打印申请表（登记表选择受让，写上原证书登记号）、并提供转让双方身份证明文件加盖公章、原登记证书原件以及加盖公章的复印件，转让合同（转让合同中应当明确转让的软件名称及版本号、转让权利范围、转让地域范围、合同生效日期等内容，合同应当符合著作权法及合同法的基本要求）。整个周期大致需要3个月以上，在材料准备时也可以将查询和转让登记材料同时提交，等软著申请的查询结果出来后以补正的方式补充提交查询结果。

可以办理加急，加急程序可以免去查询阶段的准备，较优选可以选择31-35个工作日加急（从受理日起算）所以整个周期也会在2个月左右，额外加急费是300元。

还有一种方式是以转让方或受让方为申请人填写的“计算机软件著作权转让合同和专有许可合同登记申请表”，该方式是对双方转让合同进行登记以证明转让行为生效，与第一种方式效力一样，但这样受让方不能取得登记证书。通常建议采取第一种登记方式并根据需要选择是否加急。

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