软件著作权的转让是指软件著作权的原权利人将其拥有的软件著作权全部或部分转移给他人。在软著转让过程中，原权利人将软件著作权的所有权转让给另一方，另一方成为新的软件著作权权利人。

软著转让后，原权利人将不再拥有该软件著作权，并丧失了相关的权利。新的软件著作权权利人将获得该软件的所有权和相关权利，包括复制权、发行权、表演权、放映权、广播权、信息网络传播权等。除非另有约定，一般情况下，转让后的软件著作权完全归新的权利人所有。如果您对具体的软著转让问题有进一步的详细需求，建议您咨询专业的机构获取准确的相关建议。

在软著转让协议中，双方可以约定一些特殊条款，如是否允许原权利人在转让后继续使用软件等。这些条款需要在双方达成一致的情况下，通过书面合同进行明确规定。

软著转让的申请流程可按照以下步骤进行：

协商双方达成一致：原软件著作权权利人与转让接受方需进行协商，就软著转让事项达成一致，并制定转让合同或协议。

转让合同准备：制定书面的软著转让合同，明确双方的权益和义务。合同内容可包括转让的软著具体信息、转让方式、转让价款、转让的范围和期限等。

软著登记信息变更申请：原软件著作权权利人需向国家版权局申请软著登记信息的变更。申请材料通常包括转让合同、身份证明等。申请方式：1.自主提交；2.找专业代理机构提交。

提交申请材料：将软著登记信息变更申请材料提交给国家版权局。申请可以通过在线提交等方式完成。

审核及登记：国家版权局对申请材料进行审核，如符合要求，则进行软著转让登记，将软著权属信息变更为新的权利人。

软著证书领取：一般情况下，国家版权局会核准软著转让登记后颁发新的软著证书给新的权利人。

请注意，具体的软著转让申请流程可能因地区和实际情况而有所不同，建议您在进行软著转让前详细了解当地相关规定，并在需要时咨询专业的代理机构获取准确的建议。