如果您的公司名称发生了变更，那么您申请的软件著作权通常也需要跟随进行变更。

由于软件著作权是与公司或个人的身份相关联的，如果公司名称发生了变更，软件著作权的登记信息也应该相应更新以保持一致性和合法性。这样可以确保著作权的所有权归属正确，并避免可能的纠纷。

要进行软件著作权的变更，您可以采取以下步骤：

提交申请：向负责软件著作权登记的知识产权局或相关机构提交变更申请。请准备好原有著作权证书、公司变更的相关文件和证明材料，如公司名称变更证明、营业执照副本等。

更新登记信息：在申请中明确说明变更的内容，包括公司名称、注册号、地址等，并提供所需的证明文件和资料。根据不同国家或地区的规定，可能还需要填写特定的申请表格。

等待审批：一旦您提交了申请，您需要等待著作权登记机构的审批。审批时间可能因地区而异，通常需要一定的处理时间。

确保在进行软件著作权变更申请时，与知识产权局或专业代理机构进行沟通，并遵循他们的具体要求和程序。